Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Prrt1O35449 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Prrt1O35449 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt1O35449 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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