Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf11aO35305 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf11aO35305 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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