Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smad6O35182 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Smad6O35182 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smad6O35182 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Smad6O35182 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms