Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pitx3O35160 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms