Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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H2-Q1O19441 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Q1O19441 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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