Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube3aO08759 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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