Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp35M0QWN7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp35M0QWN7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp35M0QWN7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Usp35M0QWN7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp35M0QWN7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp35M0QWN7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp35M0QWN7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Usp35M0QWN7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp35M0QWN7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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