Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gm20939L7N243 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20939L7N243 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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