Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2888K7N746 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms