Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vwa3bJ9JI28 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vwa3bJ9JI28 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vwa3bJ9JI28 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vwa3bJ9JI28 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Vwa3bJ9JI28 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vwa3bJ9JI28 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms