Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm5294J3QP53 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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