Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21060J3KMU4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21060J3KMU4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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