Protein–RNA interactions for Protein: J3KMK6

Gm21775, Predicted gene, 21775, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21775J3KMK6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21775J3KMK6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms