Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm29394H3BIW7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm29394H3BIW7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms