Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp9yF8VPU6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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