Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm340F6RGI3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms