Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmod3E9QA62 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms