Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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R3hdm1E9Q9Q2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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R3hdm1E9Q9Q2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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R3hdm1E9Q9Q2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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R3hdm1E9Q9Q2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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R3hdm1E9Q9Q2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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R3hdm1E9Q9Q2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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R3hdm1E9Q9Q2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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R3hdm1E9Q9Q2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
R3hdm1E9Q9Q2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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