Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf169E9Q7F2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf169E9Q7F2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf169E9Q7F2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf169E9Q7F2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf169E9Q7F2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf169E9Q7F2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf169E9Q7F2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf169E9Q7F2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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