Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt78E9Q0F0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt78E9Q0F0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms