Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fndc1E9Q043 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fndc1E9Q043 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms