Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20425E9Q035 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms