Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms