Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms