Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc6D3YZP9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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