Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm4950D3YUM8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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