Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Phf11bB4XVQ1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Phf11bB4XVQ1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms