Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cspp1B2RX88 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms