Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms