Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usf3B2RUQ2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms