Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rrn3B2RS91 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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