Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NhsB1AV60 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NhsB1AV60 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NhsB1AV60 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NhsB1AV60 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NhsB1AV60 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NhsB1AV60 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NhsB1AV60 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NhsB1AV60 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NhsB1AV60 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NhsB1AV60 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms