Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M5A7VMS3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M5A7VMS3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms