Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Samt1A2BED8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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