Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn3aA2ASI5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Scn3aA2ASI5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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