Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbbp8nlA2ABX0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms