Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb4A2A863 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms