Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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