Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A0A0U1RNP2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A0A0U1RNP2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms