Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Lrit3W8DXL4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms