Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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