Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms