Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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