Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn8Q9Z260 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn8Q9Z260 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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