Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn9Q9Z0S7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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