Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sh3bgrQ9WUZ7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sh3bgrQ9WUZ7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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