Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamc3Q9R0B6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lamc3Q9R0B6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms