Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AmfrQ9R049 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms