Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms