Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn8Q9QZ49 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms